由哥本哈根大學、深圳華大基因研究院等多家單位組成的研究團隊，成功破譯了約70萬年前生活在加拿大地區的史前馬的全基因組序列圖譜，并利用該基因組信息闡釋了馬的進化歷程，相關研究日前在《自然》雜志發表。這是迄今為止破譯的最古老的基因組，比去年完成的丹尼索瓦人基因組還要古老10倍，這項研究為包括遠古人類在內的諸多已滅絕物種的基因組圖譜繪制，奠定了重要的遺傳學基礎。
2003年，一個研究團隊在加拿大育空領地薊溪遺址古老的永久凍土層，發現了冰封已久的馬骨骼化石碎片。該馬骨化石來自于一匹遠古馬的腿部，距今約有56萬至78萬年的歷史。DNA會隨著時間的推移而逐步降解，理論和經驗證據均表明該馬古化石的DNA已經接近保存的臨界值。而且到目前為止，還沒有11萬至13萬年以上的古DNA全基因組測序信息。然而通過初步的分析，該化石殘存有一小部分膠原和血液。由此，研究人員決定重構該古馬的遺傳信息。
同時作為對照，研究人員還對一匹4.3萬年前的馬、5匹現代家養馬品種、一只普氏野馬和一只驢進行了全基因組測序。通過進一步的進化分析發現，現代馬、驢和斑馬最近的共同祖先存在的時間大約在400-450萬年前，比過去認為的時間要向前推進了兩倍，因此，它們有足夠長的時間進化成現在的馬屬種群。
同時，研究人員還發現，在過去的200萬年間，馬屬種群發生了多次波動，特別是在氣候劇變時期，多個冰期使得草原面積擴張，馬的數量經歷了一系列起伏。研究人員推斷，普氏野馬和現代馴化馬的種群分化大約是在3.8萬至7.2萬年前。同時，基因組學數據表明，普氏野馬并未與現代馴化馬進行雜交，這也支持了普氏野馬確實是現存最后一種真正的野馬這一觀點。
此外，研究人員還發現了一些在馬的進化中免疫系統和嗅覺系統受到不斷選擇的證據。最終，研究人員發現與普氏野馬相比，在不同的現代家養馬品種之間，鑒定出29個低水平的遺傳變異區域，這些區域可能成為馴化的遺傳標記。